Después de la Segunda Guerra Mundial, las repúblicas de la Unión Soviética alteraron sus banderas para traer rayas de colores nacionales. Tayikistán fue el último en hacerlo. Las banderas tayikas soviéticas anteriores habían sido rojas con el habitual emblema comunista de la hoz, martillo y estrella sobre el nombre del estado en letras doradas. El 20 de marzo de 1953, Tayikistán agregó dos franjas horizontales, blancas sobre verde claro, a la Bandera Roja Soviética con su hoz y su martillo dorado y la estrella roja bordeada de oro. El verde representaba la viticultura y los productos agrícolas, mientras que el blanco representaba el algodón que había hecho famoso a Tayikistán.

Tayikistán proclamó su independencia el 9 de septiembre de 1991, pero nuevamente fue lento para alterar su bandera. El nuevo diseño, que data del 24 de noviembre de 1992, incorpora los mismos cuatro colores que la bandera de 1953. Ahora se dice que el verde representa la producción agrícola, mientras que el rojo es un símbolo de soberanía estatal. El blanco tiene el mismo significado que antes, en referencia a la cosecha de algodón. La corona en el centro de la franja blanca está coronada con un arco de siete estrellas doradas: se dice que representan la unidad entre las diferentes clases sociales del país, incluidos los trabajadores, los campesinos y los intelectuales.