A mediados del siglo XIX, la bandera utilizada por Egipto presentaba una luna creciente blanca y una estrella de cinco puntas en el centro de un campo rojo. Más tarde, bajo el reinado de Isma’il Pasha y Tewfik Pasha, la bandera cambió ligeramente, con la forma de la luna creciente siendo alterada y ahora presentando tres estrellas en lugar de una sola. A principios del siglo XX, la bandera se cambió nuevamente para presentar un campo rojo con tres lunas crecientes idénticas y tres estrellas en el lado izquierdo de la bandera.

Cuando la región fue designada como el Reino de Egipto, la bandera fue cambiada nuevamente. Esta vez, el diseño presentaba un campo verde con una luna creciente blanca y tres estrellas de cinco puntas en el centro. Esta bandera fue utilizada hasta la década de 1950. Después de la Revolución de 1952, se utilizó la bandera Revolucionaria y de Liberación. Presentaba bandas de rojo, blanco y negro con el símbolo nacional en el centro. El diseño varió ligeramente de la bandera moderna de hoy. Esta bandera se usó hasta 1958.

En ese momento, se introdujo otro diseño cuando la nación se unió con Siria como la República Árabe Unida. La bandera presentaba bandas rojas, blancas y negras con dos estrellas verdes de cinco puntas en la banda blanca. Esta bandera estuvo en uso hasta 1972. Cuando el país fue renombrado como Federación de Repúblicas Árabes el mismo año, la bandera fue cambiada nuevamente, esta vez con el Halcón de Qureish en el centro. Esta bandera se usó hasta 1984, cuando la República Árabe de Egipto adoptó la bandera que todavía se usa en la actualidad.